XaOS, очень плохо понимаю о чем речь, какие настройки, ты про файл app/bootstrap.php или про bootstrap.css и причем тут тема
свои стили пиши в theme.blade.php
там есть пример, если не нужны встроенные стили тогда удали @yield('styles')
и пропиши свои
но лучше не удалять, многие элементы использую bootstrap.css
просто не используй его и все