ну смотреть код надо поидее, но чаще всего запросы в цикле грузят типа while(....){
mysql_query('SELECT * ..');} или же постоянные коннекты mysql_pconnect, но думаю это вряд ли, и вообще не думаю что один бот даже 2 запросами в секунду может нагрузить, многие сайты и не такой онлайн выносят, думаю все таки пора искать более мощный сервер