61. wapek, насчет безопасности, после доделывания последнего модуля системы прогоняли еще раз весь код, проверяли все ли обрабатывается на выводе. По поводу SQL инъекций беспокоиться не стоит, используются подготовленные выражения.
По скорости - генерация глаз вроде как радует. Но также зависит от сервера, если слабенькая VDS какая-нибудь или не оптимизированное ПО, то на нем конечно же будет притормаживать, но это не от нашей системы зависит.
Шаблонизатор не используется. По статистике дизайнеры отлично делают шаблоны к файлам, если в них содержится PHP код, их это обычно не пугает. Кстати по вашему вопросу, шаблонизаторы как раз замедляют работу системы, хоть незначительно, но такие цифры есть. Все файлы расположены интуитивно понятно, в папке dialog - диалоги, в папке modules - отдаваемые какие-то части страниц и прочие не полноценные страницы, в папке pages - основные страницы сайта. В принципе, с этим разберетесь при загрузке системы 1 декабря