Отличная бесплатная программа для автоматического "причесывания" скриптов на PHP.
Аккуратно выравнивает код "лесенками", расставляя все необходимые отступы и переносы.
Результат можно сразу просмотреть и при необходимости сохранить.
Поддерживает работу через командную строку, параметры вызова можно посмотреть в прилагаемой документации.
Версия 1.0.1 теперь полностью консольная, и легко прикручивается к любым приложениям.