PHP аналог apt

Добрался до механизма установки, обновления и удаления пакетов в моей системе (аналог apt-get для php). Установить и удалить пакет (каталог файлов php) не составляет особого труда, но есть проблема с обновлением пакетов, прошу навести на мысль.
Имеем модуль (каталог с php классами) для которого определена его версия. Для данного модуля можно повысить версию, если обновить некоторые (или все) входящие в него файлы. Вопрос: как обновить модуль в случае, если для его обновления требуется его же участие?
Для не понявших проблему объясню, если интерпретатор будет использовать любой из файлов модуля в своей работе, то удалить этот файл уже будет нельзя и обновление не удастся, в ОС это решается путем перезагрузки компьютера.

Копируешь во временен папку и устанавливаешь текущую директорию chdir() на исходную?

Что копирую? Используемый интерпретатором старый модуль?

Если модуль можно сделать прокси для этого, подключать модули которые обновляются через прокси из временной директории.

Можно подробнее?

1. Перед началам обновы копировать модуль во временную папку.
2. Добавить код в часть где подключается модуль обновляется ли он, если да то загружать из временной папки.

А как узнать что модуль не используется и его можно удалять?

Добавлено через 00:13 сек.
Или реализовать что то вроде перезагрузки системы?

Добавлено через 06:23 сек.
Я думаю может лучше реализовать так: есть модуль upgrade, который принимает "заказы" на обновления других модулей и даже всей системы. При получении "заказа", модуль складывает его в журнал обновлений, но ничего не обновляет. Обновление производится встроенным в модуль, но не зависящим от загрузчика системы классом (что позволяет не париться на счет использования обновляемых файлов) в определенный момент (когда системой никто не пользуется). Этот момент определяет системный администратор

Прочитать список модулей из временной папки или сохранить куда то?

8. Муз-ТВ, второе

Можно использовать файл конфигурации для каждого модуля, в котором обозначена версиия, и подключать модуль последней версии. Если появилась инфа о новой версии, асинхронно скачать новую, и со следующего запуска, уже будет новый модуль.