что за скрипт?
Добавлено через 07:43 сек.
и еще, после ошибки Internal Server Error скрипт не перестает работать
он будет висетьв трее сервера пока не повиснит сервер или пока не закончиться задача. Эта ошибка всего то означает что неполучен ответ от сервера в течении определенного времени и не более. На работу скриптов это никак не влияет. О памяти чушь
Попробуй изменить значение max_execution_time на сервере. Там по всей видимости 30-60 сек.ошибку убереш если она мешает.